Problème:
Le client avait choisi site déplacé au lieu de site copié lors d'une migration et avait une bannière d'avertissement à chaque fois qu'il basculait d'une site à un autre.
Solution:
Ce n'est pas la solution décrite dans ce ticket mais depuis WPML 4.6.8 a été publié et offre une solution très simple pour régler ce problème.