Visão geral do problema
Ao editar uma tradução de produto usando o editor padrão de produtos, as traduções existentes de atributos personalizados estão sendo excluídas.
Solução alternativa
Este problema foi corrigido em WooCommerce Multilingual 3.6.5. Atualizar resolve isso no seu site, então você só precisa desta solução alternativa se ainda não puder atualizar.
Use o editor de produtos do WooCommerce Multilingual para editar as traduções de produtos ou baixe o WooCommerce Multilingual 3.6.5-beta1 da página de downloads do WPML.org.